Adding a New Dimension to DNA Melting Curves.

Santiago Cuesta-Lopez 1 Dimitar Angelov 2 Michel Peyrard 1
1 Phys-ENS - Laboratoire de Physique de l'ENS Lyon
2 LBMC - Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule
Abstract : Standard DNA melting curves record the separation of the two strands versus temperature, but they do not provide any information on the location of the opening. We introduce an experimental method which adds a new dimension to the melting curves of short DNA sequences by allowing us to record the degree of opening in several positions along the molecule all at once. This adds the spatial dimension to the melting curves and allows a precise investigation of the role of the base-pair sequence on the fluctuations and denaturation of the DNA double helix. We illustrate the power of the method by investigating the influence of an AT rich region on the fluctuations of neighboring domains.
Keywords : DNA thermal denaturation statistical physics
Type de document :
Article dans une revue
EPL - Europhysics Letters, European Physical Society/EDP Sciences/Società Italiana di Fisica/IOP Publishing, 2009, 87 (4), pp.48009-1-6. 〈10.1209/0295-5075/87/48009〉
Liste complète des métadonnées

Littérature citée [14 références]  Voir  Masquer  Télécharger
https://hal-ens-lyon.archives-ouvertes.fr/ensl-00410290
Contributeur : Michel Peyrard <>
Soumis le : mercredi 19 août 2009 - 15:28:33
Dernière modification le : jeudi 19 avril 2018 - 14:54:03
Document(s) archivé(s) le : jeudi 30 juin 2011 - 11:46:23

Fichiers

EPL-DNA-vsF2.pdf
Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Identifiants

Collections

ENS-LYON | UNIV-LYON1

Citation

Santiago Cuesta-Lopez, Dimitar Angelov, Michel Peyrard. Adding a New Dimension to DNA Melting Curves.. EPL - Europhysics Letters, European Physical Society/EDP Sciences/Società Italiana di Fisica/IOP Publishing, 2009, 87 (4), pp.48009-1-6. 〈10.1209/0295-5075/87/48009〉. 〈ensl-00410290〉

Exporter

BibTeX TEI DC DCterms EndNote

Partager

Métriques

Consultations de la notice

103

Téléchargements de fichiers

123

Contact

support.ccsd.cnrs.fr
hal.support@ccsd.cnrs.fr
Logo CCSD